序章
序章
新地球历2079年，距离第二次世界大战过去两个甲子。人类开创出有史以来最发达的盛世局面，继智能机器人、克隆技术的蓬勃发展后，信息网络技术被熟练的运用在各个领域。伊甸•空中花园（Eden •Sky Garden），第一艘光速宇宙移民舰“空中花园”的建成是众望所顺的世纪工程，而这次举全球之力的大协作，也将人类社会推向“统一和进步”的黄金时代（Golden Age）。然而也正是这种高智能，让人类再次陷入了恐惧的深渊。
在这之后不久，一种名为帕弥什（Punish）的病毒爆发。最初，帕弥什病毒以极高的密度从人类第一座零点能反应堆的真空腔体中现身在其不断进行质量展开的过程中，引发了泄漏爆炸，使其随大气环流最终蔓延至全球。帕弥什病毒能够直接破坏生物体细胞，或通过操控逻辑电路使机械体呈现被感染状态并对任何具有人类意识行为的个体，展现出极其强烈的攻击欲望。病毒的DNA结构中含有金属结构，感染体的类型包括但不限于电子设备设施,机械体，各感染体会根据其自身特性表现出诸如改造,增殖,破坏等不同行为但最终目的都是为了更高效地消灭所有人类意识个体，且自身体内的帕弥什病毒浓度越高,攻击欲望就越强烈,破坏力也会越强。在这之中诞生出一批能够控制病毒并且允许它们在接受帕弥什病毒深度感染的同时，仍然维持自我意识，并获得强大的力量。这些成员称自己为升格者（Upgrade）。成员们结成组织的起因不详，但能确定的是,它们正把帕弥什病毒作为工具向人类乃至全世界“传播”着它们的理念。升格者相互之间通过“升格网络”共享着一种十分特殊的能力，能力来源于病毒意志传播的代行者（Executer）。
病毒爆发之后，空中花园的建设被迫停止，并接纳了绝大多数逃往太空的幸存者。如今它作为人类夺回地球的起点，长期泊于弧形轨道，与派往地面的部队保持联系。最初，人类无法找出能够抵御这种病毒的方法，接下来，人类渡过了很长一段时间的黑暗，那个时代叫做免疫时代（Immunization Age）。直到逆元装置（Inverse element device）的出现，才使人类的命运出现转机。逆元装置是所有构造体抵御帕弥什病毒的第一道防线。以黑野技术制造出来的构造体为载体，构造体是将人类意识转移到机器上，但由于这样意识海容易发生偏移，所以需要在人类中选拔出意志坚定的指挥官。在人类阵线的升级方案中，允许构造体们通过逆元装置接收附近指挥官的思维信标这也是如今“构造体+指挥官”战术体系形成的重要前提。
帕弥什病毒的灾难——爆发于我们曾经最引以为傲的前沿科学领域中，在几十年的时间里，将人类在地球上干百年来构建的文明成果鲸吞蚕食，迫使我们流亡深空。构造体与指挥官们，你们所做出的勇敢选择将成为重新点燃这片黑夜的,最珍贵的星火。愿每一位重返家园的人类之子平安——哈桑，人类阵线领袖，演讲于反击时代开端。演讲就此拉开反击时代（Cunterattack Age）。
随着第一百七十个感染体信号消失，四周暂时安静下来。浑身是伤的露西亚倒在成堆的感染体残骸中，胸口不定地起伏，似乎正在努力调整自己的呼吸。“指挥官……周围的情况，现在……如何了? ”
“感染体还在向这边聚集……”
“……是吗。”她面无表情地看着眼前飞舞的星火。“指挥官……这次行动配备给您的抗帕弥什免疫血清……现在还剩下多少? ”
“实际上，刚才注射的已经是最后一支血清……”
“果然……和我的计算一样。免疫血清如果耗尽的话，有着人类躯体的指挥官，是无法在地表继续生存的。灰鸦小队其他队员的支援还没有到位……现在只能由我来为指挥官争取足够的撤离的时间了。 可是,痛觉信号一直在影响着我,指挥官。请您帮助我暂时关闭痛觉信号，让我继续战斗。”
指挥官叹了口气。
“怎么了……?是在担心这样做的话，我的意识海会永久偏离人类意识模型吗?您一直都会在乎这种事情呢……没事的，我相信指挥官，只要我们保持意识连接，指挥官的思维信标就可以让我维持住人性。对于这个武断的决定，等您安全返回基地之后，我再主动向您检讨，行吗? ”
允许露西亚关闭痛觉信号。
系统:“权限通过，正在重设神经参数……意识海偏离系数上升0.021……”
露西亚:“等……我，指挥官。”
一个感染体发现了指挥官的行动。在利刃劈下来之前，指挥官用匕首挡住，一拳打在感染体的胸口。
系统:“知觉系统初始化进行中——构造体:露西亚，已下线。”
意识重新上线的这段时间，也是露西亚唯一一段需要被保护的时间。所以，现在需要做的事就只有一件——子弹上膛。感染体不顾一切的冲向指挥官。感染体的身体各处被子弹击穿——但丝毫没有被减速的势头。下一刻，感染体手中狰狞的刀刃已高举在眼前。
随后，一记重拳，感染体千疮百孔的上半身结构被击成四散的碎片。即便如此，剩下的无数其他感染体，仍然向着这边聚集……
“不准靠近……指挥官……”
初始化成功，意识:露西亚，已重新上线——露西亚
“报告，构造体露西亚现已重返战斗——指挥官……辛苦你了，接下来前方就继续交给我吧”
切断了痛觉的露西亚，就像是解脱了束缚一般，驰骋于战场，如同粉碎机一般高效地破坏着四周的感染体。然而无数感染体所构成的包围圈仍然在逐渐缩小。就在此时，“信号接入中——”
丽芙:“指挥官!露西亚!探测到你们的位置，即将使用远程的进攻武器，请你们就近寻找掩体!”
“指挥官，快趴下!”随后，指挥官淹没在白光之中。
“指挥官，接下来往这边。”率先反应过来的露西亚赶紧拉住指挥官撤退，但一路上露西亚都在警惕地进行着战斗，视线冷酷地扫视四周，劈开了一个又一个伺机而动的感染体。“指挥官，怎么了?请继续跟紧我。”
“露西亚，附近已经没有感染体了。”
“抱歉，指挥官，我现在的样子一定很奇怪。意识海偏离的症状.看来开始出现了”
“我会在你身边，帮助你保持稳定”
“可是……我现在的状况……”
“不用勉强自己，接下来的路线交给我吧”
经过了一段短暂的喘息时间，终于和露西亚一起来到了目的地，一处被地铁口废墟遮蔽的角落。阴影之下，站着一名表情不满的青年，以及一位看似有些踌躇的娇小少女。
“丽芙和里都没事吧。”
“但露西亚你伤的好重，还有指挥官也。”丽芙是小队的医疗兵，对于受伤状况自然是最关心的一个。
“凭借这样的伤势，你们是怎么出来的。”里问道，一边环顾四周，虽然已经会和但不满的神情没有一丝改变。
“我切断了痛感痛觉信号。”
“真是个鲁莽的计划。”在里核对完数据之后，展开了分析：刚才的超载远程攻击使丽芙的浮游炮核心熔毁了。而自己的手臂也受了伤。“对了，指挥官。我想你应该会需要用到，所以刚才给你捡来了几支免疫血清。从哪捡来的就别问了，估计你也能猜得到。总之是摆脱感染体的伏击了，继续下一步计划吧，指挥官。”
“嗯，重复一下，我们的任务是参与这座015号城市的收复行动。当完成清除区域内感染体的任务之后，工程部队就会抵达，而内部有一个隐蔽的实验室，里面有重要的关于感染体的资料，以及建设这片区域的资料，取到这份资料会对建设此地有重要作用。届时我们就，可以把015号城市建立成人类阵线在地球上的一处新据点了。”
确认完任务之后，决定先和支援小队会合，然后继续探索。
露西亚: “呃！教堂。”
“露西亚，这座教堂怎么了吗?”
“没有，只是一些既视感而已，偶尔……会出现……”
里：“毕竟意识海系统是对人类思维基底的完全模拟，这种情况也不稀奇就是了。”
丽芙：“或许是你去过的地方太多了吧，毕竟你的战斗经历非常丰富。”
“各位的战斗经历都很丰富。”
里：“指挥官你好像把自己排除在外了?我们的指挥官。”
露西亚：“我已经没事了，我们继续吧。”
顺着教堂走去，在隐蔽的角落，明显有机关的痕迹。指挥官敲了敲，把机关转了个方向，随即，大门打开。里面是实验室。
“那边研究人员所说的实验室就是这里吗，如果能找到资料的话，那么任务就完成了。”
里调适了一下这里的设备，“哎……这里的所有数据都被清空了，没有任何有关的资料。”
“说不定还有其他地方有再找找看。”
回到教堂，在教堂尽头的黑暗中，出现了一位神秘的白发的女性。
丽芙: “对方是一构造体，是友军吗？”
此时白发的女性构造体周身，忽然闪烁起诡异的红色电流。
丽芙:“不对……这是……极高浓度帕弥什反应! 对方是感染体!
“指挥官……我现在好像……有点奇怪……”露西亚的眼睛眯了起来，随后身体似乎是要向后倾倒。
“冷静下来，露西亚。”指挥官勉强维持住露西亚的意识海，并用手抬住露西亚企图让一切恢复正常。
露西亚: “我无法辨识她的外貌……像是视觉信号发生了错误，思绪也有些混乱……”
丽芙: “我这边看得很清楚啊。”
里:“看来是只有露西亚会这样。”
丽芙: “等等……露西亚的意识海稳定程度在下降!但并不是受到帕弥什病毒的影响，这是怎么回事? ”
不明构造体一边朝露西亚缓缓走来，一边无言地从腰间抽出柄鲜红的长刀。: “露西亚，以红渊为名，斩断错误的根源。”
露西亚: “可恶”。
以肉眼不可见的速度向着露西亚冲去。露西亚自觉向背后砍去，果然红渊打算从后背进攻，这样的冲击力使露西亚后退了几步，双方的刀刃不断碰撞出火花。
“露西亚，你现在的实力只有这些了吗？让深渊的业火了结这一切。”
自称红渊的升格者表情忽然凌冽了起来，但这次，露西亚手中的刀被弹飞到了半空。
对方轻易地抬手捉住了半空中露西亚的刀，然后将露西亚钉在断壁上，封锁住了她的行动。“被切断了痛感吗，真是悲哀。是时候结束这一切了。”
“露西亚!”正准备上前的丽芙想到自己没有武器，而且连露西亚都应付不了的敌人自己肯定是无法做到的。
一颗子弹穿过两人之间。
“……人类，果然还是改不了这样的毛病。”
里立即对红渊射击，可并未减慢对方来的速度，只是一瞬，便来到了面前。
指挥官拿出战术刃——无铭，向对方挥去，可红渊只一击，就在指挥官身上留下与露西亚相同位置的伤痕。病毒在指挥官身上蔓延，但只要血管没破，血清就能阻止感染。
“你以为你真的能和自己的队员感同身受吗。”
“对，因为我们的意识连在一起。”
“看来你们还不知道真相，就让这个指挥官告诉你什么事真理吧。”说完，她仿佛失去兴趣一般，向着周围的支撑物发出了猛烈的进攻。指挥官淹没在废墟之中，但体内的血清忽然暴动了起来，瞬间消灭了所有的病毒，而且自己的力量也恢复了不少，就好像刚才所发生的一切都只是虚无的一样，所有的疲劳在一瞬间全都消失了。但在正前方一根支柱倒塌下来后，也陷入了昏迷。